Boa tarde,
No sistema com que trabalho, tratamos NF-e com a chave com 44 dígitos; no caso de NFS-es, guardamos 3 informações mesmo:
* CNPJ do prestador, que é da empresa emitente;
* número da NFS-e (fornecido pela Ginfes)
* código de verificação (fornecido pela Ginfes)
os dois itens fornecidos pela Ginfes vem na resposta do serviço deles, após enviar o RPS.
Att,